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/ Software Vault: The Diamond Collection / The Diamond Collection (Software Vault)(Digital Impact).ISO / cdr16 / med9505d.zip / M9550824.TXT < prev    next >
Text File  |  1995-03-25  |  3KB  |  43 lines
  1.        Document 0824
  2.  DOCN  M9550824
  3.  TI    The structure of unliganded reverse transcriptase from the human
  4.        immunodeficiency virus type 1.
  5.  DT    9505
  6.  AU    Rodgers DW; Gamblin SJ; Harris BA; Ray S; Culp JS; Hellmig B; Woolf DJ;
  7.        Debouck C; Harrison SC; Department of Molecular and Cellular Biology,
  8.        Harvard University,; Cambridge, MA 02138.
  9.  SO    Proc Natl Acad Sci U S A. 1995 Feb 14;92(4):1222-6. Unique Identifier :
  10.        AIDSLINE MED/95166801
  11.  AB    The crystal structure of the reverse transcriptase (RT) from the type 1
  12.        human immunodeficiency virus has been determined at 3.2-A resolution.
  13.        Comparison with complexes between RT and the polymerase inhibitor
  14.        Nevirapine [Kohlstaedt, L.A., Wang, J., Friedman, J.M., Rice, P.A. &
  15.        Steitz, T.A. (1992) Science 256, 1783-1790] and between RT and an
  16.        oligonucleotide [Jacobo-Molina, A., Ding, J., Nanni, R., Clark, A. D.,
  17.        Lu, X., Tantillo, C., Williams, R. L., Kamer, G., Ferris, A. L., Clark,
  18.        P., Hizi, A., Hughes, S. H. & Arnold, E. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci.
  19.        USA 90, 6320-6324] reveals changes associated with ligand binding. The
  20.        enzyme is a heterodimer (p66/p51), with domains labeled fingers, thumb,
  21.        palm, and connection in both subunits, and a ribonuclease H domain in
  22.        the larger subunit only. The most striking difference between RT and
  23.        both complex structures is the change in orientation of the p66 thumb
  24.        (approximately 33 degrees rotation). Smaller shifts relative to the core
  25.        of the molecule were also found in other domains, including the p66
  26.        fingers and palm, which contain the polymerase active site. Within the
  27.        polymerase catalytic region itself, there are no rearrangements between
  28.        RT and the RT/DNA complex. In RT/Nevirapine, the drug binds in the p66
  29.        palm near the polymerase active site, a region that is well-packed
  30.        hydrophobic core in the unliganded enzyme. Room for the drug is provided
  31.        by movement of a small beta-sheet within the palm domain of the
  32.        Nevirapine complex. The rearrangement within the palm and thumb, as well
  33.        as domain shifts relative to the enzyme core, may prevent correct
  34.        placement of the oligonucleotide substrate when the drug is bound.
  35.  DE    Binding Sites  Crystallography, X-Ray  DNA-Binding Proteins/CHEMISTRY
  36.        HIV-1/*ENZYMOLOGY  Protein Conformation  Pyridines/CHEMISTRY  Reverse
  37.        Transcriptase/ANTAGONISTS & INHIB/*CHEMISTRY  Support, Non-U.S. Gov't
  38.        Support, U.S. Gov't, P.H.S.  JOURNAL ARTICLE
  39.  
  40.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  41.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  42.  
  43.